Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRCP23327 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HRCP23327 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HRCP23327 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HRCP23327 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRCP23327 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRCP23327 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRCP23327 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRCP23327 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRCP23327 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRCP23327 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRCP23327 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms