Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TNFRSF1BP20333 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms