Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms