Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms