Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TIMM17BO60830 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms