Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGTAO43765 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGTAO43765 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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