Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DENRO43583 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DENRO43583 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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