Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QRK9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QRK9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms