Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms