Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms