Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms