Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CAB39Q9Y376 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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