Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms