Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC7AQ9ULT0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms