Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms