Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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