Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RNF7Q9UBF6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RNF7Q9UBF6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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