Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HACD3Q9P035 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms