Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms