Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms