Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZYG11BQ9C0D3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZYG11BQ9C0D3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms