Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF4Q9BZC1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms