Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms