Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms