Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNAQ96QF7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms