Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms