Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms