Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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