Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PERM1Q5SV97 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms