Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms