Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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