Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTRK2Q16620 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms