Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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