Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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