Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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