Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MELKQ14680 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MELKQ14680 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms