Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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