Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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