Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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