Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms