Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP6Q0PNE2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP6Q0PNE2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP6Q0PNE2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP6Q0PNE2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ELP6Q0PNE2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP6Q0PNE2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms