Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms