Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK18Q07002 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms