Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP2P78314 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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