Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms