Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPZ1P61923 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms