Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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