Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TSPOP30536 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms