Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.46e-12■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-207ENST00000448782 975 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.556e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 PPT2-252ENST00000465047 238 ntTSL 311.59□□□□□ -0.556e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.566e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-217ENST00000526917 663 ntTSL 311.5□□□□□ -0.576e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 MCL1-203ENST00000464132 1099 ntTSL 29.27□□□□□ -0.936e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 59.22□□□□□ -0.936e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-214ENST00000489990 1012 ntTSL 59.06□□□□□ -0.966e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.136e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.166e-12■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-204ENST00000435274 2670 ntTSL 56.83□□□□□ -1.326e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-215ENST00000495776 2831 ntTSL 26.52□□□□□ -1.376e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.376e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 PDLIM1-203ENST00000490391 458 ntTSL 26.42□□□□□ -1.386e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NDUFS1-210ENST00000498520 593 ntTSL 26.35□□□□□ -1.393e-6■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.46e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.46e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.466e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-209ENST00000458603 455 ntTSL 35.62□□□□□ -1.516e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-226ENST00000534040 575 ntTSL 44.82□□□□□ -1.646e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-223ENST00000532975 581 ntTSL 44.78□□□□□ -1.646e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.846e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TFG-206ENST00000481203 3271 ntTSL 23.29□□□□□ -1.886e-12■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-208ENST00000449627 909 ntTSL 43.24□□□□□ -1.896e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-218ENST00000527631 563 ntTSL 43.1□□□□□ -1.916e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.966e-12■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 51.76□□□□□ -2.136e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 OSBPL9-212ENST00000484890 640 ntTSL 30.44□□□□□ -2.346e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 213.7□□□□□ -0.227e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 CKAP4-203ENST00000553039 573 ntTSL 44.62□□□□□ -1.675e-16■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TM9SF3-204ENST00000475401 511 ntTSL 22.29□□□□□ -2.043e-34■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.828e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.558e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.478e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.478e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 AFP-206ENST00000514279 693 ntTSL 25.92□□□□□ -1.461e-323■■□□□ 12.4
RPS3P23396 DDX5-228ENST00000584279 676 ntTSL 319.09■□□□□ 0.655e-24■■□□□ 12.4
RPS3P23396 DDX5-232ENST00000585111 1051 ntTSL 215.09■□□□□ 0.015e-24■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-18■■□□□ 12.4
RPS3P23396 DDX5-233ENST00000585223 699 ntTSL 210.94□□□□□ -0.665e-24■■□□□ 12.4
RPS3P23396 DDX5-231ENST00000585060 572 ntTSL 49.11□□□□□ -0.955e-24■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-18■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 57.68□□□□□ -1.181e-18■■□□□ 12.4
RPS3P23396 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-18■■□□□ 12.4
RPS3P23396 PYCR1-211ENST00000582198 868 ntTSL 513.51□□□□□ -0.256e-8■■□□□ 12.4
RPS3P23396 LRP1-209ENST00000555941 499 ntTSL 311.04□□□□□ -0.646e-10■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TMED5-203ENST00000370290 3847 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.586e-8■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-8■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TM9SF1-204ENST00000525592 882 ntTSL 319.39■□□□□ 0.693e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 TM9SF1-205ENST00000528010 904 ntTSL 214.89□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-16■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 420.88■□□□□ 0.932e-57■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.864e-30■■□□□ 12.4
RPS3P23396 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 415.34■□□□□ 0.052e-57■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-209ENST00000573618 710 ntTSL 58.6□□□□□ -1.031e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-208ENST00000573251 894 ntTSL 38.12□□□□□ -1.111e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 27.97□□□□□ -1.131e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-206ENST00000572090 759 ntTSL 37.67□□□□□ -1.181e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.221e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-205ENST00000571988 509 ntTSL 36.35□□□□□ -1.391e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 RSL1D1-203ENST00000570767 871 ntTSL 55.11□□□□□ -1.591e-7■■□□□ 12.4
RPS3P23396 PBXIP1-205ENST00000493133 707 ntTSL 312.46□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 12.3
RPS3P23396 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 58.42□□□□□ -1.064e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.44e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 DSP-203ENST00000506617 754 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 DCXR-220ENST00000585085 927 ntTSL 522.91■■□□□ 1.261e-10■■□□□ 12.3
RPS3P23396 DCXR-211ENST00000579821 452 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-10■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.411e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.48e-8■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.938e-8■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PTPRF-214ENST00000496043 415 ntTSL 512.29□□□□□ -0.448e-8■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PTPRF-213ENST00000481019 459 ntTSL 311.91□□□□□ -0.58e-8■■□□□ 12.3
RPS3P23396 MYH9-210ENST00000486218 788 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-6■■□□□ 12.3
RPS3P23396 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 317.97■□□□□ 0.471e-8■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 12.3
RPS3P23396 PNRC2-203ENST00000471915 380 ntTSL 310.43□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 12.3
RPS3P23396 GPI-210ENST00000589504 536 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-13■■□□□ 12.3
RPS3P23396 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-36■■□□□ 12.3
RPS3P23396 RPL34-205ENST00000503574 2627 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-36■■□□□ 12.3
RPS3P23396 RPL34-206ENST00000504231 629 ntTSL 1 (best)7.38□□□□□ -1.235e-36■■□□□ 12.3
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