Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms